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有機肥的使用出現效果不佳的原因很多，在此分兩大類(lèi)（不包括病害這一類(lèi)）。

　　第一類(lèi)：生產(chǎn)企業(yè)的原因。

　　企業(yè)生產(chǎn)控制方面的原因里面涉及到質(zhì)量控制，在這里重點(diǎn)討論養分、pH、氯離子含量、含鹽量、陽(yáng)離子交換量、腐植酸、小分子脂肪酸、重金屬、有害微生物等因素。這些內容有很多并不出現在有機肥料行業(yè)標準里面，但卻不得不注意。

　　1. 養分。由于原材料本身養分低或發(fā)酵生產(chǎn)工藝原因，有些企業(yè)的有機肥發(fā)酵出來(lái)，其養分并不合格，加上有些廠(chǎng)連化驗室都沒(méi)有，一批產(chǎn)品就這樣邁向了市場(chǎng)。有些企業(yè)檢測發(fā)現養分不夠，但也舍不得添加化肥補充，也使這些產(chǎn)品邁上了市場(chǎng)。無(wú)肥料登記證的企業(yè)所生產(chǎn)出來(lái)的產(chǎn)品，并不在市場(chǎng)上流通，一般是直接面向用戶(hù)，這一塊特別難以監管。

　　2. pH值。原材料本身pH值就各有不同，在發(fā)酵過(guò)程中，pH值變化也較大，如果發(fā)酵過(guò)程控制不好，有可能發(fā)酵出來(lái)會(huì )發(fā)現pH值在8.5以上，或5.5以下。特別是過(guò)酸的產(chǎn)品會(huì )導致農作物生長(cháng)受阻或死亡，而過(guò)堿的有機肥料，由于南方土壤普遍偏酸，危害反而不大。

　　3. 氯離子含量。一般沒(méi)有人會(huì )去檢測氯離子含量，但有些原料卻含有不少的氯離子，特別是在嚴重忌氯的作物上使用時(shí)，會(huì )出現嚴重問(wèn)題。也有些廠(chǎng)家使用氯化銨這一類(lèi)含氯化肥加入到有機肥中，以提高總養分中的氮，這也是導致氯離子含量增高，影響農作物的生長(cháng)。

　　4. 含鹽量。肥料鹽份高，就好像把一包食鹽灑到有限的地里，作物很受影響。一般來(lái)說(shuō)，生活污泥、廚余垃圾等原料的鹽份較高，不耐鹽的作物會(huì )出現黃葉、掉葉、萎蔫、死亡等現象。當堆肥EC值小于9.0ms/cm3時(shí)，對種子發(fā)芽沒(méi)有抑制作用。

5. 陽(yáng)離子交換量。一般腐熟的有機肥，其陽(yáng)離子交換量大，保肥肥力，緩沖能力強，對pH、鹽份有很好的緩沖作用，對于維持土壤的良好狀況有著(zhù)很重要的作用。而沒(méi)有腐熟的有機肥甚至是曬干就賣(mài)的糞便，其陽(yáng)離子交換量極低，起不到應有的緩沖效果，相反，還會(huì )危害土壤本身的緩沖效果，造成作物生長(cháng)障礙。

　　6. 腐植酸。新鮮原料幾乎不含有腐植酸，腐植酸是在有機肥發(fā)酵生產(chǎn)過(guò)程中不斷產(chǎn)生的，以高溫發(fā)酵（大于50℃）尤為明顯。腐植酸與銨、鉀、鈉結合，具有刺激作物生長(cháng)的功能，也具有易吸引的效果，也可提高作物抗逆性，促產(chǎn)，促萌發(fā)，腐植酸更可因為其交換能力而增強土壤緩沖能力。

　　7. 小分子脂肪酸。低級脂肪酸對種子發(fā)芽和植物生長(cháng)有不良影響。小分子脂肪酸易招引蒼蠅，這比較容易觀(guān)察出來(lái)。一般來(lái)說(shuō)，小分子脂肪酸存在于未腐熟的物料中，如新鮮雞糞等。其所帶來(lái)的危害是：小分子脂肪酸會(huì )抑制種子萌發(fā)，會(huì )抑制根系生長(cháng)。

　　8. 重金屬。重金屬會(huì )在植物中積累，最終通過(guò)食物鏈集中到人身上，對人造成傷害。同時(shí)重金屬也會(huì )對農作物的生長(cháng)造成損害。由于設備昂貴，大部分企業(yè)是沒(méi)有設備對重金屬進(jìn)行檢測的，農資市場(chǎng)到現在才多見(jiàn)執法部門(mén)對重金屬進(jìn)行檢測。

　　9. 有害微生物。堆肥溫度在50℃以上的時(shí)間不少于5天，可以殺死病原菌及蟲(chóng)卵，達到無(wú)害化。但實(shí)際上很多廠(chǎng)家有機肥生產(chǎn)過(guò)程中，由于工藝水平原因，未能達50℃以上或達到了卻時(shí)間維持過(guò)短，大部分蛔蟲(chóng)卵、大腸菌群等未能大部分殺滅，這就影響了作物健康生長(cháng)。